本课程讲解TCGA数据库差异表达分析和转录因子调控网络,是TCGA又一创新课程
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单个基因GSEA富集分析,课程是GSEA富集分析课程的一个很好补充,讲解如何做单基因GSEA富集分析
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GEO数据库挖掘,多芯片联合Batch分析
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R语言生信绘图高级篇,用实例讲解生信绘图,包括三种柱状图的绘制、箱体图绘制、热图绘制等十七种图形
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此视频主要讲解Perl语言在生物信息学语言的应用。视频分为两部分
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讲解临床数据下载提取、临床数据分析,临床组间差异表达,多组临床差异分析
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WGCNA(加权基因共表达网络分析)利用基因表达数据,构建出加权的基因共表达网络,从而挖掘协同表达的基因模块,探索基因模块与性状之间的关系。
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甲基化驱动基因课程是TCGA甲基化差异分析生存分析的高级课程,是当前分析的热点。
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SEER数据库挖掘视频课程,SEERstat软件数据下载整理,用R软件绘制列线图
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SEER数据库挖掘是临床医学的重要研究方法,SEER数据库包括大量临床数据,SEER数据库课程包括基础课程和高级课程,高级课程3部分内容,竞争风险模型,多原发癌,Joinpoint软件操作
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质控和reads长度统计,差异表达和靶基因,新miRNA
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UCSC数据库下载整理基因上游序列,perl脚本提取基因上游1000bp,TFBSTools包做转录因子结合位点预测
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GO富集分析是基因功能研究非常重要的一部分内容,DAVID在线工具可以做GO富集分析,得到富集通路,用R软件做GO柱状图,GO圈图。
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GEO多芯片联合分析,GEO数据库数据下载,多个芯片分别做差异分析,使用R脚本联合多个芯片做分析,得到更加可靠的挖掘结果
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GEO芯片分析课程,芯片数据下载,芯片数据处理,基因名称转换,差异分析,热图火山图绘制,归一化分析
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TCGA数据库挖掘高级课程,结合基础课程和ceRNA网络构建,可以对TCGA数据库做很多分析,课程包括单因素cox分析,多因素cox分析,ROC曲线
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