课程试学
课程目录:
TCPA数据库简介,软件准备,TCPA蛋白数据下载,TCPA数据整理,临床数据下载,临床数据提取,蛋白表达和生存数据合并,筛选预后相关蛋白,火山图绘制,蛋白预后模型构建,模型蛋白的生存分析,风险生存曲线,风险曲线,独立预后分析输入文件准备,独立预后分析,多指标ROC曲线,蛋白共表达分析,桑基图绘制。
TCPA数据库简介
TCPA数据库通过整合来自TCGA和几个独立的肿瘤研究项目的RPPA芯片数据,提供了一个肿瘤蛋白质谱数据中心。TCPA包含两个独立的Web应用程序,第一个着眼于患者肿瘤的RPPA数据,其包含癌症基因组图谱中32种癌症类型越8000个样本,另外约500个来自独立患者队列的样本。第二个应用侧重于癌细胞系的RPPA数据,包含19个谱系的>665个独立细胞系。
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