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课程目录:
单细胞Scissor算法简介,软件安装,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,区分mRNA和lncRNA,GEO数据下载,GEO数据注释,TCGA突变数据下载,计算肿瘤突变负荷,单细胞数据下载,单细胞数据整理,单细胞数据分析,细胞通讯,单细胞scRNAtoolVis可视化,选择基因集数据,AUCell分析,GO和KEGG富集分析,提取差异基因的表达量,TCGA表达数据和生存数据合并,GEO表达数据和生存数据合并,查找预后相关的基因,构建机器学习预后模型,生存分析,独立预后分析,ROC曲线,临床相关性圈图,列线图,决策曲线,GSEA分析,免疫细胞浸润,免疫细胞差异分析,准备瀑布图输入文件,瀑布图,药物敏感性(oncoPredict),药物敏感性差异分析,单细胞Scissor分析,Scissor高低风险组细胞通讯
课程亮点:






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