课程试学:
课程目录:
TCGA线粒体氧化膜破裂死亡简介,软件安装,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,区分mRNA和lncRNA,GEO数据下载,GEO数据注释,TCGA突变数据下载,计算肿瘤突变负荷,单细胞数据下载,单细胞数据整理,单细胞数据分析,细胞通讯,单细胞scRNAtoolVis可视化,AUCell分析,提取差异基因的表达量,TCGA表达和生存数据合并,GEO表达和生存数据合并,查找预后相关的基因,预后模型SHAP分析,生存分析,独立预后分析,ROC曲线,临床相关性圈图,贝叶斯反卷积(BayesPrism),反卷积细胞的差异分析,反卷积细胞的生存分析,肿瘤突变负荷差异分析,肿瘤突变负荷生存分析,模拟基因敲除(scTenifoldKnk),GO和KEGG富集分析。
课程亮点:






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