课程试学:
课程目录:
R-loop分析简介,软件安装,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,区分mRNA和lncRNA,GEO数据下载,GEO数据注释,TCGA突变数据下载,计算肿瘤突变负荷,单细胞数据下载,单细胞数据整理,单细胞数据分析,细胞通讯,单细胞scRNAtoolVis可视化,获取R-loop相关的基因,提取R-loop相关基因的表达量,TCGA表达和生存数据合并,GEO表达和生存数据合并,查找预后相关的基因,构成机器学习预后模型,生存分析,ROC曲线,独立预后分析,列线图,决策曲线,风险差异分析,GO富集分析(功能),KEGG富集分析(功能),肿瘤微环境,肿瘤微环境差异分析,免疫细胞浸润,免疫细胞差异分析,模型基因气泡图,细胞轨迹分析,单细胞Scissor,高低风险组细胞通讯分析,空间转录组数据下载,空间转录组数据整理,空间转录组数据分析。
课程亮点:






赣公网安备36090202000386号


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