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GEO芯片分析课程,芯片数据下载,芯片数据处理,基因名称转换,差异分析,热图火山图绘制,归一化分析
从GEO数据库下载表达谱芯片数据
归一化处理:芯片矫正的过程,在没有做归一化时,各芯片整体的表达值,中位值不在同一根水平线上;归一化之后表达量的中位值在同一条水平线上
差异表达:实验组和对照组做差异表达分析,得到差异表达基因
火山图:横坐标-log10(adj P.Val),矫正后的P值是越小,差异的可能性越大;纵坐标logFC;黑色的点没有差异的基因,红色代表有差异的基因
热图:低表达用蓝色表示,高表达用红色表示
内容基础,适合入门,讲解清晰,无基础的自己也没什么压力
很适合基础入门,学了这个课程之后,GEO的芯片分析感觉很简单,代码都有了,直接安装软件,下载芯片就可以跑出结果,大气
讲解清晰,资料发送快,网盘发货,会继续支持
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