课程简介:
TCGA数据库挖掘又推出一门课程,甲基化分析,是继TCGA基础课程,cox风险回归模型,ceRNA网络构建之后的又一力作,从此TCGA挖掘又4门课程,TCGA的三剑客到TCGA的四大金刚,是学习分析的好资料,是论文开题的领路人。
TCGA数据库包括丰富的数据类型和肿瘤类型,不需要任何费用即可获得大量数据,其次在TCGA下载的数据已经经过了前期繁琐的标准化处理,节省了人工处理时间和资源。
TCGA甲基化课程讲解TCGA数据库甲基化数据下载提取,差异分析, 热图绘制。基因甲基化和表达相关性,位点甲基化和表达现骨干性,生存分析,甲基化和表达联合生存分析。
同时提供课程需要的脚本文件,老师在线回答学员问题。
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。
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Illumina Human Methylation 450K BeadChip芯片可检测人全基因组近450,000个甲基化位点,具有单碱基的分辨率。全面覆盖了96%的CpG岛,并根据需求加入了CpG岛以外的CpG位点、人类干细胞非CpG甲基化位点、正常组织与肿瘤(多种癌症)组织差异甲基化位点、编码区以外的CpG岛、miRNA启动子区域和GWAS疾病相关区域的位点,同时覆盖了Human Methylation27 BeadChip的90%的位点。
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最有帮助的评价(2)
买了就学习运行了下,自己电脑确实内存不够,问了客服说可以帮忙下载数据,这服务不错,收费也不贵。
购买每个新出的视频,这次也不例外,初步浏览了一下,这个课程比之前的课程要难,下载数据的时候就发现了,数据很大,对电脑要求比较高