《KEGG富集分析》
在生物体内,不同基因互相协调行驶其生物学功能,基于Pathway的分析有助于更进一步了解基因的生物学功能。通路数据库(PATHWAY database)储存了基因功能的相关信息,包括代谢,膜运输,信号传导和细胞的生长周期等。
Pathway显著性富集分析以KEGG Pathway为单位,应用超几何检验,找出与整个基因组背景相比,在差异基因中显著性富集的Pathway.
KEGG数据库
id转换
KOBAS
clusterProfiler R package
Cytoscape可视化
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KEGG讲解,还是要买课程,这里找那里找,免费的都是套路,花点钱提高效率
功能分析首选课程,值得学习,讲的很详细