GO富集分析
GO(Gene ontology)按照生物过程(Biology Process),分子功能(Molecular Function)和细胞组成(cellular component)对基因进行注释和分类。
通过对差异基因进行GO terms富集度统计学的分析,计算出差异基因GO term的p-value和p-value的FDR值(q-value),定位差异基因最可能相关的GO term。
Uniprot(http://www.uniprot.org/)
DAVID(http://david.abcc.ncifcrf.gov/)
可视化
GOplot R package
最有帮助的评价(3)
学习了GEO的课程,再学GO功能分析,做出来的图和看到的文献差不多,很有成就感,谢谢乐老师耐心答疑
没想到GO可以画这么多图,真的很实用,按照课程画出的图都很漂亮,老师解释很耐心
课程内容丰富,学习完可以做出很多实用的,最重要的是,不需要基础,直接操作就可以执行代码,这个适合我这种