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课程目录:
网络毒理学联合SHAP分析简介,软件安装,GEO数据下载,GEO数据注释,单个数据矫正,数据合并,箱线图,PCA分析,差异分析,WGCNA共表达分析,差异基因和WGCNA模块基因取并集,化合物结构,化合物靶点(ChEMBL),化合物靶点(SwissTargetPrediction),化合物靶点(SEA),化合物靶基因取并集,化合物靶基因和疾病基因取交集,化合物调控网络,GO富集分析(功能),KEGG富集分析(通路),准备机器学习输入文件,构建机器学习诊断模型,SHAP可解释性分析,火山图,ROC曲线,蛋白的结构数据,分子对接。
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讲解不啰嗦,重点都标出来了,回看找知识点方便。
TCMSP筛成分那段讲得清楚,靶点预测和富集都能跑通,写中药类文章够用。