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适用人群
TCGA数据挖掘的科研人员,癌症相关研究人员,生物信息学分析员,生物、计算机相关专业师生,医学研究人员
课程概述
TCGA数据库,是癌症分析利器,可以免费下载整体好的基因在样本的表达量。
本课程内容精简,操作简单,案例选取一个癌症为例,经过15个课时的学习,就可以熟练挖掘TCGA数据库,分析癌症数据。
同时提供课程需要的脚本文件,老师在线回答学员问题。
本课程是生物信息学专业课程,需要用到一些专业术语,遇到不明白的可以提问或者直接检索。
*购买课程可以加QQ:2749657388,获得更多帮助。
师资
讲师:乐老师
严谨的治学风格,课程讲解简单易学,讲师生物信息科班出身,从事生物信息相关工作8年,熟悉操作各类生信软件,语言编程。精通GEO芯片分析,TCGA数据库挖掘。
课程目录
章节1:TCGA数据库数据下载整体
课时1:TCGA数据库简介
课时2:TCGA数据库网页下载数据
课时3:TCGA数据库命令行下载数据
课时4:TCGA数据库原始数据提取矩阵文件
课时5:TCGA数据库ID转换成基因名
章节2:TCGA数据库GENE差异表达分析
课时6:TCGA数据库差异表达介绍
课时7:TCGA数据库用edgeR包做差异分析
课时8:TCGA数据库用DESeq包做差异分析
章节3:TCGA数据库miRNA差异表达
课时9:TCGA数据库miRNA数据下载与整体
课时10:TCGA数据库miRNA差异表达分析
章节4:TCGA数据库共表达分析
课时11:TCGA数据库共表达数据合并
课时12:WGANA做共表达网络
章节5:TCGA数据库做生存分析
课时13:TCGA生存分析数据准备
课时14:TCGA数据用R做生存分析
最有帮助的评价(8)
这么经典的课程,真是教科书级别的,谢谢同时推荐,谢谢老师的讲解,让我这样的小白也入门了,TCGA我来了,即使深似海我也要做肿瘤分析,哈哈
看到有论坛说这个是TCGA的经典,买来学习,确实超值,等入门了购买其他课程
师兄介绍购买的,确实是TCGA入门首选课程,内容丰富,简单易学。
思路清晰,讲解易通,是自己需要的课程,老师指导很给力
大家的Perl进行文件提取合并的脚本可以用吗?我的好像用不了哎!
学这个课程很划算,有个同事花了3000多报了培训班,学到的和这个差不多,老师讲解很清晰,解答也很到位。
多次购买,课程超赞的,入门首选
同时学习了这个基础课程,和Cox预后模型的课程,看能不能发篇论文,看了别人的论文,也简单,这次发文成功,就得好好感谢乐老师