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课程目录:
单细胞ssGSEA分析简介,软件安装,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,区分mRNA和lncRNA,GEO数据下载,GEO数据注释,TCGA突变数据下载,计算肿瘤突变负荷,单细胞数据下载,单细胞数据整理,单细胞数据分析,细胞通讯,选择基因集数据,单细胞ssGSEA分析,TCGA数据库ssGSEA分析,WGCNA分析,交集基因,提取交集基因的表达量,TCGA表达和生存数据合并,GEO表达数据和生存数据合并,查找预后相关的基因,构建机器学习的预后模型,生存分析,独立预后分析,ROC曲线,临床相关性分析,风险差异分析,GO富集分析(功能),KEGG富集分析(通路),GSEA富集分析,肿瘤微环境分析,肿瘤微环境差异分析,免疫细胞浸润,免疫细胞差异分析,免疫细胞相关性分析,肿瘤突变负荷差异分析,肿瘤突变负荷生存分析,免疫逃逸和免疫治疗,药物敏感性(oncoPredict),药物敏感性差异分析。
课程亮点:






赣公网安备 36090202000081号


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上新好快,要光俊老师推荐了一些精品课程学习,收获满满。