课程试学:
课程目录:
干细胞文章套路简介,软件准备 ,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,区分mRNA和lncRNA,GEO数据下载,GEO数据注释,TCGA突变数据下载,计算肿瘤突变负荷,肿瘤微环境分析,免疫细胞浸润分析,计算干细胞指数,干细胞生存分析,干细胞指数分布图,干细胞临床相关性分析,肿瘤微环境临床相关性分析,肿瘤微环境相关性分析,ssGSEA分析,免疫细胞差异分析,干细胞差异分析,GO富集分析(功能),KEGG富集分析(通路),差异基因分型,分型生存分析,分型热图,分型免疫细胞差异分析,免疫检查点差异分析,GSVA分析,提取差异基因的表达量,TCGA表达数据和生存数据合并,GEO表达数据和生存数据合并,预后相关的基因,构建预后模型,生存分析,独立预后分析,ROC曲线,风险曲线,列线图和校准曲线,肿瘤突变负荷差异分析。
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