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课程目录:
癌症相关成纤维细胞简介,软件准备,转录组数据下载,转录组数据整理,临床数据下载,提取临床信息,区分mRNA和lncRNA,GEO数据下载,GEO数据注释,TCGA突变数据下载,计算肿瘤突变负荷,TCGA数据库CAF打分,GEO数据库CAF打分,TIDE免疫治疗打分,TCGA数据库CAF生存分析,GEO数据库CAF生存分析,TCGA数据库WGCNA分析,GEO数据库WGCNA分析,交集核心基因,GO富集分析,KEGG富集分析,提取核心基因表达量,TCGA表达和生存数据合并,GEO表达和生存数据合并,预后相关的基因,构建预后模型,生存分析,CAF打分相关性分析,风险热图相关性热图,免疫治疗分析,GSEA分析,ssGSEA分析,瀑布图输入文件准备,瀑布图,肿瘤突变负荷相关性分析,CAF与肿瘤突变负荷相关性,药物敏感性(oncoPredict),药物敏感性差异分析,CCLE数据库验证,免疫组化(HPA数据库)。
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