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GEO数据库肿瘤微环境(免疫细胞/基质细胞/ESTIMATE)
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课程目录:
GEO数据库肿瘤微环境简介,软件准备,GEO数据下载,GEO数据注释,肿瘤微环境,肿瘤微环境评分和生存数据合并,肿瘤微环境评分和生存关系,肿瘤微环境评分和临床数据合并,肿瘤微环境评分和临床相关性分析,基质细胞分组差异分析,免疫细胞分组差异分析,肿瘤微环境差异交集,基因名转化为基因id,GO富集分析,KEGG富集分析,蛋白互作网络构建,蛋白互作网络核心基因,批量化生存分析输入文件准备,批量化生存分析。
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TCGA肿瘤微环境出了有段时间了,终于得到GEO的肿瘤微环境了,点赞
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