课程目录:肿瘤干细胞文章套路简介,转租数据下载,转录组数据整理,id转换,临床数据下载,临床数据整理,mRNAsi差异,生存分析输入文件准备,mRNAsi生存分析,临床相关性输入文件准备,mRNAsi临床相关性,差异基因筛选,WGCNA共表达分析,Key基因提取,Key基因差异表达,Key基因热图绘制,Key基因相关性,Key基因蛋白互作网络,基因名字转换为id,Key基因GO富集分析,Key基因KEGG富集分析。
课程简介:肿瘤干细胞(Cancer Stem Cell, CSC),是指肿瘤中具有自我更新能力并能产生异质性肿瘤细胞的细胞。肿瘤干细胞对肿瘤的存活、增殖、转移及复发有着重要作用。
干细胞指数(stemness indices)是描述肿瘤细胞与干细胞相似性的指标。 mRNAsi是基于表达数据计算的指数, mDNAsi是基于甲基化数据计算的指数,EREG-mRNAsi指数是干细胞表观调控相关基因的表达量训练得到,指数范围在0到1之间,约接近于1说明细胞分化程度越低,干细胞特征越强。
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