单细胞测序是指在单个细胞水平上进行测序。单细胞转录组测序（single cell RNA ,scRNA-seq）是指对于单个细胞水平上将mRNA反转录扩增后进行高通量测序的技术。
单细胞测序通过在单个细胞水平上进行测序，解决了用组织样本无法获得不同细胞间的异质性信息或样本量太少无法进行常规测序的难题，为科学家研究单个细胞的行为、机制等提供了新的方向。
课程主要内容：单细胞测序分析简介，数据下载，数据整理，质控和数据过滤，PCA分析，TSNE分析，Marker基因，注释细胞类型，细胞轨迹分析，GO富集分析和圈图，KEGG富集分析和圈图；
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