SEER数据库挖掘视频课程,SEERstat软件数据下载整理,用R软件绘制列线图
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WGCNA(加权基因共表达网络分析)利用基因表达数据,构建出加权的基因共表达网络,从而挖掘协同表达的基因模块,探索基因模块与性状之间的关系。
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GSVA基因集变异分析视频(Gene Set Variation Analysis/GO/KEGG/通路矩阵)
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R语言生信绘图高级篇,用实例讲解生信绘图,包括三种柱状图的绘制、箱体图绘制、热图绘制等十七种图形
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此视频主要讲解Perl语言在生物信息学语言的应用。视频分为两部分
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TCGA数据库挖掘基础课程,讲解TCGA数据库数据下载,id转换,差异分析,热图火山图,生存分析
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单个基因GSEA富集分析,课程是GSEA富集分析课程的一个很好补充,讲解如何做单基因GSEA富集分析
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网络药理学/药效团靶点预测视频(药物调控网络构建/中药网络药理学)
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基因组可视化视频(genome/karyoploteR/线性基因组/生物信息学)
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CCLE数据库挖掘视频(肿瘤细胞系/共表达/功能分析/GSEA富集)
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甲基化驱动基因课程是TCGA甲基化差异分析生存分析的高级课程,是当前分析的热点。
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讲解临床数据下载提取、临床数据分析,临床组间差异表达,多组临床差异分析
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本课程讲解TCGA数据库差异表达分析和转录因子调控网络,是TCGA又一创新课程
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GEO数据库挖掘,多芯片联合Batch分析
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单基因批量化筛选视频(TCGA数据库/筛选预后相关基因)
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本课程讲解中药网络药理学,中药网络药理学可视化
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COX模型验证视频(train组/test组/COX比例风险回归模型/预后)
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ICGC数据库SNP突变挖掘视频(肿瘤突变负荷/生存分析)
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TCGA数据库批量挖掘miRNA视频(区分3p和5p/靶基因预测/批量生存分析)
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miRNA芯片数据挖掘文章套路视频(联合mRNA芯片分析/GEO数据库)
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