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ExoRBase外泌体数据库简介,软件准备,exoRBase数据下载,mRNA差异分析,lncRNA差异分析,circRNA转换id,circRNA差异分析,预测mRNA结合的miRNA,预测lncRNA结合的miRNA,预测circRNA结合的miRNA,Cytoscape输入文件准备,调控网络可视化,symbol转换为id,GO富集分析,KEGG富集分析。
ExoRBase数据库:
外泌体(exosome),是由细胞分泌的一种直径在30-150nm之间的囊泡,属于细胞外囊泡的一种,含有不同种类的RNA,可以调节受体细胞的行为,并且可以作为疾病的循环生物标记物,在血液,唾液,尿液等多种体液种都广泛存在。
exoRBase数据库收集的血液外泌体样本种各种RNA的数据,包括circRNA、lncRNA、mRNA等。一共92个样本,58330个circRNA、15501个lncRNA、18333个mRNA。
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正好有自己分析的研究对象,一直关注这个数据库,苦于自己不知道如何分析,这下好了,生信自学网出教程了,非常棒