课程试学

课程目录：

TCPA数据库简介，软件准备，TCPA蛋白数据下载，TCPA数据整理，临床数据下载，临床数据提取，蛋白表达和生存数据合并，筛选预后相关蛋白，火山图绘制，蛋白预后模型构建，模型蛋白的生存分析，风险生存曲线，风险曲线，独立预后分析输入文件准备，独立预后分析，多指标ROC曲线，蛋白共表达分析，桑基图绘制。

TCPA数据库简介

TCPA数据库通过整合来自TCGA和几个独立的肿瘤研究项目的RPPA芯片数据，提供了一个肿瘤蛋白质谱数据中心。TCPA包含两个独立的Web应用程序，第一个着眼于患者肿瘤的RPPA数据，其包含癌症基因组图谱中32种癌症类型越8000个样本，另外约500个来自独立患者队列的样本。第二个应用侧重于癌细胞系的RPPA数据，包含19个谱系的>665个独立细胞系。