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共表达网络构建蛋白互作网络

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4人评论

匿名用户

2018-10-07 20:32:02

课程内容非常丰富,学到很多方法,实用好用

九零后医生

2018-01-13 13:44:34

构建网络这个课程还是很实用,学习TCGA,用到这个课程结果已经出来了,老师解答还是很到位的。

Xinmin

2017-11-10 10:19:52

很多论文都有网络图,学习了这个课程,我也可以加一个,乐老师很赞

manada16

2017-10-15 10:10:42

这个课程很实用,做共表达分析,PPI网络构建

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共表达网络构建 

蛋白互作网络和共表达网络

主要内容:

蛋白互作网络的构建(String)

共表达网络构建

1、表达相关性

2、WGCNA

3、Cytoscape

如果是两个基因,可以直接使用表达相关性的方法,得到表达相关性

如果差异基因数目多,用WGCNA方法来做共表达

蛋白互作网络概念:

蛋白质的互相作用(PPI,Protein-protein interraction)是指蛋白质分子之间存在相互作用,可以从生物化学、信号转导和遗传网络的角度研究这种相关性

PPI网络中的每个节点代表一种蛋白质,节点之间有连线代表它们之间存在相互作用关系。圆圈代表基因,线条代表基因间存在相互作用,圆圈内部的结果代表蛋白的结构,线头颜色代表证明蛋白之间存在相互作用的不同证据。


共表达网络构建

共表达网络构建

共表达网络构建

  • [录制平台]Windows
  • [电脑配置]Win10 8G
  • [视频课时]4个课时
  • [课程总时长]164分钟
  • [脚本语言]Perl&R语言
  • [资料大小]10.5M
  • [视频格式]一机一码MP4
  • [视频发送]网盘发货