适用人群

生物信息学学员，高校生物、计算机相关专业教师、学生，医学科研人员，医院从业人员，生物专业相关从业人员

课程概述

RNA修饰是一种转录后水平的调控方式，目前已鉴定到超过150种RNA修饰，它们广泛分布于各类RNA，如信使RNA（mRNA）、转运RNA（tRNA）、核糖体RNA（rRNA）、非编码小RNA（sncRNA）和长链非编码RNA（lncRNA）。
RNA甲基化修饰约占所有RNA修饰的60%以上，而m6A（6-甲基腺嘌呤）是高等生物mRNA上最为常见的一类RNA甲基化修饰。转录本m6A的修饰水平受甲基转移酶（编码器）、结合蛋白（读码器）和去甲基化酶（消码器）的动态调控。
本课程是生物信息学专业课程，需要用到一些专业术语，遇到不明白的可以提问或者直接检索。
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分析方法：1、TCGA官网下载表达数据、临床数据；数据整理，临床提取；

2、m6A相关基因表达，差异分析得到差异结果，绘制m6A相关基因热图、小提琴图；

3、肿瘤分型subtype，也是本课程最重要的内容，当然也是当前生信挖掘的的重点内容，根据m6A相关基因表达量，把肿瘤样本进行分型、聚类，可以做主成分分析，生存分析，临床相关性分析；

4、接下来构建风险模型，首先做单基因COX分析，找到和预后相关的基因，然后做Lasso回归构建模型，风险生存分析、ROC曲线。

5、风险与临床相关性的热图

6、独立预后分析